نرم افزار حسابداری در ایران از اواخر دهه 60 وارد بازار شد و در این زمان شرکت‌های خیلی کمی بودند که این نرم افزار را منتشر کرده بودند. شایگان سیستم یکی از شرکت‌های پیشرو در تولید نرم افزار حسابداری بوده است که در اوایل دهه 70 نرم افزار خود را وارد بازار نمود. این نرم افزار در محیط داس برنامه‌نویسی شده بود و توانست مشتریان زیادی را در بازار به دست بیاورد. برند این نرم افزار حسابگر سایبراکانت می‌باشد و بعدها در محیط ویندوز پیاده‌سازی شد. همگام با تغییرات سازمان‌ها و افزایش نیاز کاربران، نسخه تحت وب این برنامه نیز طراحی شد. با استفاده از نرم افزار حسابداری تحت وب شایگان سیستم کاربران می‌توانند از نقاط مختلف جغرافیایی و در زمان‌های مختلف به داده‌های برنامه حسابداری دسترسی پیدا نمایند و قادر به ویرایش و مدیریت اطلاعات حسابداری، انبار، فاکتورها و ... باشند. همچنین برای شرکت‌های پخش، شایگان سیستم نرم افزار مخصوص به آن‌ها را تحت عنوان نرم افزار پخش مویرگی توسعه داده است.
یک نرم افزار حسابداری خوب، نرم‌افزاری است که با گذشت زمان و با افزایش اطلاعات دچار کندی در کار نشود و خطاهای سیستمی در آن رخ ندهد. شایگان سیستم نرم‌افزاری است که ده‌ها هزار کاربر در سراسر ایران و کشورهای همسایه دارد و روزانه به تعداد کاربران این نرم افزار افزوده می‌شود. یک نرم افزار حسابداری مناسب باید بتواند با تنظیمات متنوع، امکانات گسترده‌ای را در موقعیت‌های مختلف و گاه متضاد برای کاربران فراهم آورد و هر چقدر این امکانات سیسستماتیک‌تر و پارامتریک‌تر باشند برای کاربران بیشتری قابل استفاده خواهد بود.
یکی از ویژگی‌های نرم افزار حسابداری شایگان، به‌روزرسانی‌های منطبق بر تغییرات کسب‌وکارها و یا قوانین و مقررات مالیاتی روز می‌باشد تا کاربران بتوانند طبق آخرین تغییرات از این نرم افزار استفاده نمایند. برای به‌روزرسانی برنامه نیز کاربران می‌توانند به‌راحتی در وب‌سایت شایگان‌سیستم ثبت نام نمایند و پس از ورود اطلاعات نسخه نرم افزار حسابداری، فایل به‌روزرسانی را دانلود نمایند. همچنین چنانچه کاربران برنامه نیاز به تغییری در امکانات برنامه داشته باشند می‌توانند به مسئول رسیدگی به درخواست‌ها در شرکت انتقال نمایند تا امکان این تغییر توسط کارشناسان مربوطه پیگیری شود.
یکی دیگر از امکانات منحصربه‌فرد نرم افزار حسابداری شایگان، چندزبانه بودن برنامه در صورت تقاضای کاربر می‌باشد. بدین صورت که کاربران می‌توانند با زبان‌های فارسی، انگلیسی و زبان سوم با برنامه کار نمایند. در صورت استفاده از زبان سوم باید منوها و عبارات مورد نیاز برنامه را ترجمه نمایند. در نرم افزار حسابداری چندزبانه، کاربران می‌توانند منوها و امکانات متنوع برنامه را به زبان انگلیسی مشاهده و اطلاعات را نیز به صورت زبان مورد نیاز ترجمه و وارد نمایند. برای مثال در یک شرکت بین‌المللی، در محیط شبکه کاربران با زبان‌های مختلف وارد سیستم شوند.